Проблема:
На аймаке постоянно выскакивают окна при открытии каких-либо программ или просто при запуске мак. Запрашивают непонятное подключение. Типа "CleanMyMac want to connect to chrome.google.com on port 443", есть варианты выбора "any connection, only port 443, only chrome" и т.д. Очень надоедает постоянно закрывать по сто таких окошек. Помогите, как это все отключить.

Я так понимаю это из-за Cleanmymac. Попробуйте для начала его удалить совсем, включая его системные файлы. И лучше его не ставить вовсе. Он не нужен этот "чистильщик"

Подобного рода окна выскакивают не только из-за CleanMyMac, а и с другими программами. Например, когда захожу в AppStore, обязательно выскочит окошко с просьбой что-то подключить. А когда загружаю что-либо через торрент, то это просто невозможно. Он начинает дико виснуть и ничего не загружает из-за этих сто тысяч окон. И так каждый раз.

Очень сложно что-то подсказать, так как не понятно, о каких окнах речь и что на них написано. В любом случае, компьютер нужно "видеть". Удаленно сложно что-то подсказать.
Зайдите в Настройки - Пользователи и группы - Объекты входа. Что у вас там есть кроме iTunes helper?

iTunes Helper, CleanMyMac 3 Menu, Spanel (галочка на нем стоит, на остальных нет), DaemonManager
Я же написала, какие окна выскакивают и что требуют.

Тогдя я не понимаю про какие окна идет речь. В первом сообщении вы указали, что выскакивает окно, в котором написано, что CleanMyMac пытается подключиться к порту 443. Я посоветовал полностью удалить это приложение. Вы ответили, что не только из-за этого приложения выскакивают окна. То есть выскакивают другие окна с другими фразами или с такой же ("CleanMyMac want to connect to chrome.google.com on port 443)"?

Если с такой же фразой, то остаюсь при своем мнении - удалите CleanMyMac полностью. Второй момент. Компьютер домшний или рабочий?

Выскакивают окна с другими фразами. CleanMyMac удалила. Компьютер домашний.

Тогда сложно сказать. Нужно видеть эти окна и что там написано.